小麥源性成分探針法熒光定量PCR試劑盒通用原則

小麥源性成分探針法熒光定量PCR試劑盒通用原則：

1， 先選擇好探針，然后設計引物使其盡可能的靠近于探針。

2， 擴增子的長度應不超過400bp，理想的*能在100－150bp內，擴增片斷約短，有效的擴增反應就越容易獲得。較短的擴增片斷也容易保證分析的一致性

3， 保持GC含量在20％和80％之間，GC富含區容易產生非特異反應，從而會導致擴增效率的降低，及在SG分析中非特異信號。

4， 為了保證效率和重復性，應避免重復的核苷酸序列，尤其是G（不能有4個連續的G）

5， 將引物和探針互相進行配對檢測，以避免二聚體和發卡結構的形成。

b），探針設計指導

1，在設計引物之前設計探針

2，探針的Tm值應在68－70℃之間，如果是目測探針，則要仔細審查GC富含區。

3，探針的5’端要避免有鳥氨酸，5’G會有淬滅作用，即使被切割下來這種淬滅作用也還會存在

4，選擇C多于G的鏈作探針，G的含量多于C會降低反應效率，這時就應選擇配對的另一條鏈作為探針。

6， 探針應盡可能的短，不要超過30個bp。

7， 檢測探針的DNA折疊和二級結構。

PCR實驗步驟

典型的PCR由（1）高溫變性模板；（2）引物與模板退火；（3）引物沿模板延伸三步反應組成一個循環，通過多次循環反應，使目的DNA得以迅速擴增。其主要步驟是：

將待擴增的模板DNA置高溫下（通常為93℃-94℃）使其變性解成單鏈；

??人工合成的兩個寡核苷酸引物在其合適的復性溫度下分別與目的基因兩側的兩條單鏈互補結合，兩個引物在模板上結合的位置決定了擴增片段的長短；

??耐熱的DNA聚合酶（Taq酶）在72℃將單核苷酸從引物的3’端開始摻入，以目的基因為模板從5’→3’方向延伸，合成DNA的新互補鏈。