研究中證明細胞系平臺能夠模擬癌癥的遺傳異質(zhì)性和藥物響應

       8月1日，國際學術期刊Cancer Cell 在線發(fā)表了中國科學院分子細胞科學**創(chuàng)新中心（生物化學與細胞生物學研究所）惠利健研究組、中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所李亦學研究組、第二軍醫(yī)大學附屬東方肝膽外科醫(yī)院張海斌研究組以及南京大學醫(yī)學院附屬鼓樓醫(yī)院施曉雷等合作的研究成果“A Pharmacogenomic Landscape in Human Liver Cancers”。該研究公布了目前**的肝癌細胞模型庫LIMORE（Liver Cancer Model Repository）及最詳細的藥物基因組學，為肝癌特異性藥物基礎與臨床研究提供了戰(zhàn)略性的體外研究模型。

　　原發(fā)性肝癌異質(zhì)性顯著，耐藥性突出，預后不良。不同國家地區(qū)之間肝癌致病因素差異明顯，對肝癌的精準治療帶來嚴重挑戰(zhàn)。全球每年超過50%的新增病例和死亡病例均發(fā)生在中國。因此科學家們多年來致力于基于藥物基因學分析發(fā)掘新的潛在的治療策略和分子標志物。

　由大量細胞系構成的細胞系平臺在乳腺癌、肺癌等癌癥研究中證明細胞系平臺能夠模擬癌癥的遺傳異質(zhì)性和藥物響應，通過細胞系平臺可以發(fā)現(xiàn)與藥物敏感性相關的分子標志物。但是對于肝癌來說，目前發(fā)表的細胞系只有30株左右，不足以反映肝癌的基因組異質(zhì)性，特別是HBV相關的肝癌。

　　此次研究公布的肝癌細胞模型庫LIMORE包含81株肝癌細胞系，其中31株商業(yè)化肝癌細胞系，50株新建中國肝癌患者肝癌細胞系。通過大規(guī)模測序數(shù)據(jù)分析，證明LIMORE能反映原位腫瘤80%的異質(zhì)性。進一步整合高通量藥物篩選數(shù)據(jù)，研究人員建立了肝癌基因變異與藥物響應相關性，發(fā)現(xiàn)了新的治療靶點和分子標志物，為索拉非尼應答患者的預測提供了DKK1血清學指標。

　　該研究優(yōu)化了體外培養(yǎng)體系，構建了50株新的肝癌細胞系，整合已有的31株肝癌細胞系，構建了目前**的肝癌細胞系平臺；詳細描繪了81株肝癌細胞系突變譜和基因表達譜，并提供了肝癌細胞系遺傳背景和藥物響應數(shù)據(jù)庫；通過整合分析肝癌細胞系藥物響應和基因組數(shù)據(jù)，描繪了肝癌藥物基因組學的“藍圖”，發(fā)現(xiàn)了新的潛在的治療策略和分子標志物。

　　生化與細胞所邱志欣博士、博士研究生章正濤和中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所李虹副研究員為本文共同**作者，生化與細胞所惠利健、中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所李亦學、第二軍醫(yī)大學附屬東方肝膽外科醫(yī)院張海斌和南京大學醫(yī)學院附屬鼓樓醫(yī)院施曉雷為本文共同通訊作者。

研究得到了中國科學院、國家自然科學基金、上海市科委、科技部和中組部的資助。該工作得到了生化與細胞所化學生物學技術平臺、動物實驗技術平臺、分子生物學技術平臺、細胞分析技術平臺的大力支持。